肛瘘不及时治疗可能导致感染扩散、肛门功能受损、全身性并发症等危害。肛瘘是肛周脓肿破溃后形成的慢性感染性管道，需及时干预。
肛瘘长期不处理会使瘘管反复感染化脓，脓液可能向周围组织扩散形成复杂瘘管或继发肛周蜂窝织炎。持续炎症刺激可导致肛门括约肌纤维化，引发肛门失禁或排便困难。部分患者可能出现贫血、低蛋白血症等全身消耗症状，免疫力低下者还可能引发败血症。高位肛瘘可能穿透直肠壁造成直肠阴道瘘或直肠膀胱瘘，增加治疗难度。少数长期未愈的肛瘘存在癌变风险。
确诊肛瘘后应避免久坐久站，每日用温水坐浴1-2次保持会阴清洁，选择透气棉质内裤减少摩擦。饮食需增加膳食纤维摄入如燕麦、西蓝花等预防便秘，限制辛辣刺激食物。急性发作期可遵医嘱使用头孢克肟分散片、甲硝唑片等控制感染，但手术仍是根治手段。建议尽早就诊评估瘘管类型，复杂性肛瘘可能需要MRI检查明确走行，根据结果选择挂线疗法、瘘管切开术等针对性治疗。