舌根滤泡增生部分情况下可以自愈，但需根据病因和症状严重程度综合判断。舌根滤泡增生可能与慢性咽炎、反流性食管炎、长期烟酒刺激、病原体感染或免疫异常等因素有关。
生理性舌根滤泡增生通常由短期刺激引起，例如辛辣饮食、过度用嗓或轻度感冒。滤泡体积较小且无疼痛时，通过清淡饮食、戒烟酒、减少说话频率等措施，黏膜炎症可能逐渐消退。伴随咽喉干燥或异物感时，可适量饮用温水或含服西地碘含片缓解症状。
病理性增生多与持续存在的致病因素相关。胃酸反流导致的滤泡增生需抑制胃酸分泌，常用药物包括奥美拉唑肠溶胶囊；细菌感染引起的增生可能需要阿莫西林克拉维酸钾片联合康复新液含漱；过敏因素诱发的增生需避免接触过敏原，必要时口服氯雷他定片。若增生组织出现异常增大、出血或长期不愈，需警惕HPV感染等特殊情况。
日常应保持口腔清洁，使用复方氯己定含漱液减少细菌滋生，避免进食温度超过60摄氏度的食物。睡眠时抬高床头15度可减轻夜间胃酸反流。若症状持续2周未缓解或出现吞咽困难、体重下降等表现，建议进行电子喉镜或病理检查排除器质性疾病。