甲状腺功能低下能否治愈取决于具体病因，部分类型可完全恢复，部分需终身药物替代治疗。
甲状腺功能低下即甲状腺功能减退症，治愈可能性与病因密切相关。因缺碘或亚急性甲状腺炎引起的甲减，在碘补充或炎症消退后甲状腺功能可能恢复正常。自身免疫性甲状腺炎如桥本甲状腺炎导致的甲减通常不可逆，需长期服用左甲状腺素钠片维持激素水平。甲状腺手术或放射性治疗后的甲减也需终身替代治疗。部分孕妇产后出现的暂时性甲减可能在6-12个月内自愈。先天性甲减患儿若在出生后3个月内开始规范治疗，神经系统发育可接近正常，但多数需持续用药。
极少数情况下，如垂体性甲减或下丘脑病变导致的继发性甲减，在解决原发病后可能恢复甲状腺功能。药物因素如锂制剂、干扰素等引起的甲减在停药后可能好转。某些特殊类型甲减如甲状腺激素抵抗综合征，目前尚无根治方法，需个体化调整治疗方案。
甲减患者应定期监测甲状腺功能指标，遵医嘱调整药物剂量，避免自行停药。日常需保证均衡饮食，适量摄入海带紫菜等含碘食物，但桥本甲状腺炎患者不宜过量补碘。注意保暖防寒，适度进行慢走、瑜伽等低强度运动，合并血脂异常者需控制脂肪摄入。出现嗜睡、浮肿加重等异常症状应及时复诊，孕期及哺乳期女性需加强甲状腺功能监测。