甲状腺恶性结节通过规范治疗通常可以治愈。甲状腺恶性结节的治疗效果与病理类型、分期及治疗方式密切相关，早期发现并接受手术联合放射性碘治疗的患者治愈率较高。
甲状腺恶性结节中占比最高的甲状腺乳头状癌生长缓慢且预后良好，手术切除后辅以放射性碘治疗可使多数患者达到临床治愈。滤泡状癌对放射性碘治疗同样敏感，但需更密切监测血管侵犯情况。髓样癌因易发生淋巴结转移，需扩大手术范围并配合靶向药物控制。未分化癌恶性程度高且进展快，需采用手术、放疗、化疗等综合手段延缓病情。所有类型术后均需长期服用左甲状腺素钠片抑制促甲状腺激素，并定期复查甲状腺功能及颈部超声。
甲状腺恶性结节患者术后应保持均衡饮食，适量增加海带紫菜等富碘食物摄入但避免过量，规律监测促甲状腺激素水平调整药量，避免颈部剧烈运动或压迫，出现声音嘶哑或颈部肿块需立即复查。建议每3-6个月进行甲状腺功能检测和颈部超声随访，术后5年内无复发可视为临床治愈，但仍需终身随访。