男方甲状腺功能减退可能影响生育能力，但通过规范治疗多数可正常生育。甲状腺功能减退可能影响精子质量、性功能及激素水平，建议孕前进行甲状腺功能评估并遵医嘱调整药物剂量。
甲状腺功能减退可能导致精子活力下降、畸形率增加，与促甲状腺激素水平升高相关。研究显示未控制的甲减患者精液参数异常概率较高，但补充左甲状腺素钠片后多数可改善。部分患者可能出现性欲减退或勃起功能障碍，与甲状腺激素缺乏导致的睾酮合成减少有关。
少数严重甲减患者可能并发垂体增生，进一步抑制下丘脑-垂体-性腺轴功能。这类情况需要先控制甲状腺激素水平，再评估生育能力。极少数遗传性甲减可能通过基因缺陷影响后代，需进行遗传咨询。
计划生育的甲减患者应提前3-6个月就诊内分泌科，定期监测促甲状腺激素和游离甲状腺素水平，保持促甲状腺激素在2.5mIU/L以下更利于生育。日常需保证碘和硒的适量摄入，避免十字花科蔬菜过量食用影响甲状腺功能，同时规律作息、减少精神压力。配偶可同步检查抗甲状腺过氧化物酶抗体，排除潜在免疫因素对受孕的影响。