空孕囊一般可以进行药物流产，但需经医生评估确认胚胎停育且符合药物流产适应症。
药物流产适用于妊娠49天内的宫内妊娠，空孕囊属于胚胎停育的一种表现，若经超声检查确认孕囊直径小于25毫米且无胎心搏动，通常可考虑药物流产。米非司酮片联合米索前列醇片是常用方案，前者通过拮抗孕激素使蜕膜坏死，后者促进子宫收缩排出孕囊。用药前需排除宫外孕、严重贫血、青光眼等禁忌症，用药后需观察阴道出血量及组织物排出情况。
若空孕囊直径超过25毫米或存在药物流产禁忌症时，需选择人工流产。孕囊过大时药物流产可能导致不全流产风险增加，需手术清宫。合并生殖道感染、凝血功能障碍或对药物成分过敏者禁用药物流产。部分患者用药后可能出现剧烈腹痛、大出血等不良反应，需立即就医处理。
药物流产后应注意休息1-2周，避免剧烈运动和重体力劳动，保持会阴清洁干燥，每日用温水清洗外阴，2周内禁止盆浴和性生活。饮食上多摄入富含优质蛋白和铁的食物如瘦肉、动物肝脏、菠菜等，促进子宫内膜修复。术后7-10天需复查超声确认宫腔无组织残留，若出现发热、持续腹痛或出血量超过月经量等情况应及时返院检查。下次月经恢复前应采取可靠避孕措施，建议至少间隔3-6个月再计划妊娠。