斜视手术后遗症主要有复视、矫正不足或过度、眼球运动障碍、结膜充血、干眼症等。斜视手术是矫正眼位异常的常见方法，但术后可能出现短期或长期并发症。
复视是斜视物时出现双影现象，多因眼外肌调整后大脑尚未适应新眼位导致，通常数周内自行缓解。矫正不足指术后仍残留斜视，需二次手术或棱镜矫正。矫正过度则表现为反向偏斜，与肌肉张力失衡有关。眼球运动障碍常见于肌肉粘连或瘢痕形成，表现为转动受限或疼痛。结膜充血和干眼症多因手术创伤或术后用眼习惯改变引起，需人工泪液辅助缓解。
部分患者可能出现感染、结膜囊肿或角膜损伤等并发症，与个体愈合差异或护理不当相关。极少数情况下可能因术中操作导致视网膜脱离或眼内出血，需紧急处理。长期随访发现部分患者出现斜视复发，尤其儿童因眼球发育需定期评估。
术后应严格遵医嘱使用抗生素滴眼液预防感染，避免揉眼或剧烈运动。定期复查眼位和视力变化，出现持续复视或疼痛需及时就诊。日常用眼时注意劳逸结合，可进行眼球转动训练帮助肌肉功能恢复。饮食上多补充维生素A和蛋白质促进组织修复，外出佩戴防紫外线眼镜减少刺激。儿童患者家长需监督遮盖治疗和视觉训练，确保双眼视功能重建。