新鲜柠檬泡水喝通常无害，但过量饮用或特殊体质人群可能引发胃肠刺激、牙齿腐蚀等问题。
适量饮用柠檬水可补充维生素C，但高浓度柠檬酸可能刺激胃黏膜，空腹饮用易诱发反酸、胃痛。长期大量饮用酸性柠檬水会软化牙釉质，增加龋齿风险。部分人群对柠檬过敏，可能出现皮肤瘙痒、口腔肿胀等反应。柠檬中的呋喃香豆素在紫外线照射下可能引发光敏性皮炎。糖尿病患者需注意柠檬水不加糖，避免影响血糖控制。
建议每日柠檬用量不超过半个，用吸管饮用减少牙齿接触，饮用后及时漱口。胃肠敏感者避免空腹饮用，可搭配少量蜂蜜中和酸度。过敏体质人群初次尝试需观察反应，户外活动前2小时慎饮柠檬水。日常保存柠檬应冷藏避免霉变，现泡现饮以保证营养成分。若出现持续胃部不适或过敏症状，应及时就医评估。