脑血栓后遗症通常可以康复，康复程度与病情严重程度、治疗时机及康复训练规范性密切相关。
脑血栓后遗症的康复过程主要依赖于神经功能代偿和重塑。早期介入康复治疗有助于促进侧支循环建立，改善受损区域血供。肢体功能障碍患者可通过运动疗法逐步恢复肌力，语言障碍者需配合言语训练刺激大脑语言中枢重组。部分患者可能出现吞咽困难，需通过吞咽功能训练降低误吸风险。认知障碍康复需结合记忆训练和日常生活能力锻炼。
少数患者因血栓面积过大或合并多发性脑梗死，可能遗留永久性功能障碍。大面积脑梗死导致严重偏瘫或意识障碍时，康复效果可能受限。合并糖尿病、高血压等基础疾病未控制者，神经修复速度较慢。高龄患者因脑组织代偿能力下降，功能恢复难度增加。脑干等重要功能区受损时，部分后遗症可能难以完全逆转。
脑血栓后遗症患者应坚持规范康复训练，每日进行关节活动度维持和肌肉牵拉，防止挛缩畸形。饮食选择低盐低脂高蛋白食物，控制血压血糖在目标范围。家属需协助患者完成日常生活动作训练，定期评估康复进展。康复期间出现新发头晕或肢体无力需及时复查头颅CT。保持乐观心态有助于神经功能重建，睡眠障碍者可咨询医生使用佐匹克隆片等助眠药物。