甲亢三年后出现的眼球突出能否恢复正常需结合病情严重程度和治疗效果判断。部分患者通过规范治疗可改善症状，但严重病例可能遗留永久性改变。
甲状腺相关眼病的发展与甲状腺功能控制密切相关。早期积极控制甲亢并联合糖皮质激素治疗，部分患者眼球突出度可逐渐回退。轻度病例在甲状腺功能稳定后，眼部充血、水肿等症状通常能明显缓解。中重度病例若已发生眼眶脂肪增生或眼外肌纤维化，即使甲亢控制良好，眼球突出也可能难以完全复原。对于这类患者，后期可能需要通过眼眶减压手术改善外观。
病程长达三年的患者若未接受规范治疗，眼眶炎症持续存在会导致组织粘连和纤维化。这类患者即使后续采用免疫抑制剂或放射治疗，眼球复位效果也有限。但通过手术矫正仍可改善外观和视功能。少数合并视神经压迫的急进性病例，若未及时干预可能导致不可逆视力损伤。
甲亢患者出现眼球突出时应尽早就诊内分泌科和眼科，定期监测甲状腺功能和眼部体征。日常需严格戒烟，避免强光刺激，睡眠时抬高床头减轻眼部水肿。饮食注意限制碘摄入，保证充足硒和锌等微量元素。眼部干涩时可使用人工泪液，外出佩戴防紫外线眼镜。建议每3-6个月进行眼眶CT或MRI检查评估病情进展，由专科医生制定个性化治疗方案。