阴茎毛囊炎形成的硬疙瘩可能自愈，但需根据病情严重程度判断。轻度毛囊炎通常可自行消退，若伴随红肿化脓或反复发作则需医疗干预。
阴茎毛囊炎硬疙瘩的自愈与局部炎症程度密切相关。早期仅表现为轻微红肿和硬结时，保持会阴清洁干燥、避免挤压摩擦后，多数在1-2周内逐渐吸收消散。此时毛囊堵塞解除，局部免疫系统可清除细菌感染，硬疙瘩随之消退。
当硬疙瘩持续增大伴明显疼痛、黄色脓头形成或发热等全身症状时，提示金黄色葡萄球菌等病原体感染加重。此类情况可能继发疖肿或脓肿，自愈概率显著降低。需通过细菌培养明确病原体后，采用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等外用抗生素，必要时配合头孢克洛分散片等口服药物控制感染。
日常应选择透气棉质内裤并每日更换，避免使用刺激性洗剂清洁会阴。饮食减少辛辣油腻食物摄入，适当补充维生素A和锌元素有助于皮肤修复。若硬疙瘩3周未消退或出现波动感，须及时至皮肤科或泌尿外科就诊，避免自行挑破导致感染扩散。合并糖尿病等基础疾病者更需积极治疗原发病，改善局部微循环状态。