怀孕35天通常可以进行药物流产，但能否流干净需根据个体情况判断。药物流产适用于停经49天内的宫内妊娠，成功率较高，但存在不完全流产风险。
药物流产通过米非司酮片联合米索前列醇片终止妊娠。孕35天时胚胎较小，药物作用较充分，多数情况下可完整排出妊娠组织。用药后需观察阴道出血量及组织物排出情况，出血量超过月经量2倍或持续超过2周需及时就医。
少数情况下可能因胚胎位置异常、药物吸收差异或个体敏感性不足导致流产不全。此时妊娠组织残留可能引起持续出血、感染甚至大出血，需通过超声检查确认后行清宫术。药物流产后10-14天必须复查超声，确认宫腔内无残留物。
药物流产后应卧床休息2-3天，避免剧烈运动和重体力劳动1个月。保持会阴清洁，每日用温水清洗外阴，2周内禁止盆浴和性生活。饮食上多摄入含铁丰富的动物肝脏、瘦肉等，配合新鲜蔬菜水果促进恢复。观察体温变化，出现发热、腹痛加剧或异常分泌物需立即就诊。严格遵医嘱复查，未确认流产完全前不可擅自服用活血药物或热性食物。