尖锐湿疣的治疗方法需根据疣体大小、数量和部位选择，主要包括药物治疗、物理治疗和手术治疗，其中物理治疗中的激光或冷冻疗法适用于多数患者。
药物治疗适用于疣体较小且数量少的患者，常用药物有咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊和干扰素凝胶，通过局部涂抹抑制病毒增殖并促进疣体脱落，但需持续数周且可能引起皮肤刺激。物理治疗中的二氧化碳激光可精准汽化疣体，适合肛门生殖器区域的成簇疣体，治疗后创面愈合较快但需重复进行。液氮冷冻通过低温破坏疣体组织，对单发或散在疣体效果较好，操作简便但可能需多次治疗。手术治疗中的高频电刀适用于体积较大的疣体，能一次性切除病灶但术后需预防感染。光动力疗法联合氨基酮戊酸对亚临床感染和微小疣体有优势，可降低复发率但治疗费用较高。
对于免疫功能低下或反复发作的患者，可能需要联合干扰素注射增强免疫应答。妊娠期患者优先选择冷冻治疗以避免药物影响胎儿。尿道内或宫颈疣体需采用宫腔镜或尿道镜下电切术，防止器官结构损伤。治疗后均需定期复查并保持患处清洁干燥，避免性接触直至病灶完全消退。
尖锐湿疣治疗后需穿着宽松棉质内衣减少摩擦，避免使用刺激性洗剂清洁患处。饮食上增加富含维生素C的柑橘类水果和深绿色蔬菜，有助于增强免疫力。治疗期间禁止性生活，伴侣应同步检查防止交叉感染。日常注意观察是否有新发疣体，出现复发迹象时及时就医。保持规律作息和适度运动可辅助降低复发概率。