甲状腺功能亢进症一般能治好，多数患者通过规范治疗可控制症状并恢复正常甲状腺功能。
甲状腺功能亢进症的治疗效果与病因、治疗方案及患者依从性密切相关。抗甲状腺药物如甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶片等可通过抑制甲状腺激素合成改善症状，通常需持续服药1-2年，部分患者停药后可能复发。放射性碘治疗通过破坏甲状腺组织减少激素分泌，治愈率较高但可能导致永久性甲状腺功能减退。甲状腺全切或次全切除术适用于药物无效或甲状腺显著肿大的患者，术后需终身补充甲状腺激素。治疗期间需定期监测甲状腺功能，调整药物剂量以避免甲状腺功能减退或亢进复发。合并妊娠、心脏病等特殊情况时需个体化调整治疗方案。
少数难治性病例可能因甲状腺刺激抗体持续阳性或存在甲状腺恶性肿瘤导致治疗效果不佳。碘诱发性甲亢、垂体TSH瘤等特殊病因需针对原发病治疗。治疗过程中出现粒细胞缺乏、肝功能损害等严重不良反应时需立即停药并更换治疗方案。青少年患者需注意药物对生长发育的影响，老年患者需警惕心房颤动等并发症。
甲状腺功能亢进症患者应保持低碘饮食，避免海带紫菜等高碘食物，规律作息并控制情绪波动。适当补充钙质和维生素D预防骨质疏松，心率过快者可进行温和有氧运动。治疗期间每月复查甲状腺功能，出现心悸加重、体重骤降等异常及时就诊。妊娠期患者需在医生指导下调整药物剂量，避免对胎儿发育造成影响。术后患者需每日按时服用左甲状腺素钠片并定期检测激素水平。