胎停后孕囊可能自动流掉，也可能需要医疗干预。胚胎停止发育后，部分孕妇会出现自然流产现象，但部分需通过药物或手术清除残留组织。
胚胎停止发育后，若孕囊体积较小且孕妇体内激素水平下降明显，可能触发子宫收缩将孕囊排出体外。此时阴道出血量通常较多，伴随血块或组织物排出，腹痛程度类似月经或略重。超声检查可确认宫腔内无残留，血人绒毛膜促性腺激素水平会持续下降。
若孕囊滞留宫腔超过两周未排出，可能引发宫腔感染或凝血功能障碍。超声显示孕囊变形、位置下移或部分剥离，但未完全排出时，需考虑药物或手术干预。米非司酮片联合米索前列醇片可促进子宫收缩，宫腔镜下清宫术能彻底清除残留组织。
确诊胎停后应每周监测血人绒毛膜促性腺激素水平及超声变化，避免剧烈运动但可正常活动促进自然排出。流产后需禁盆浴及性生活一个月，补充铁剂纠正贫血，下次妊娠前建议完善甲状腺功能、抗磷脂抗体等检查。若出现发热、持续腹痛或大出血需立即就医。