手足口病疫苗通常建议接种，可有效预防EV71型肠道病毒引起的手足口病重症病例。
手足口病主要由肠道病毒引起，其中EV71型是导致重症和死亡的主要病原体。疫苗主要针对EV71型病毒设计，接种后能显著降低重症发生率。6月龄至5岁儿童是手足口病高发人群，也是疫苗接种的重点对象。接种程序为两剂次，间隔1个月，基础免疫完成后保护效果可持续较长时间。部分儿童接种后可能出现局部红肿或低热，通常1-2天内自行缓解。
少数情况下，对疫苗成分过敏或患有急性疾病的儿童需暂缓接种。免疫功能低下儿童接种前需咨询医生。疫苗不能预防所有类型的手足口病，但能有效防控最危险的EV71型感染。目前国内使用的EV71疫苗安全性良好，严重不良反应发生率极低。
除接种疫苗外，预防手足口病还需注意日常卫生管理。家长应培养儿童勤洗手的习惯，特别是在饭前便后。幼儿园等集体机构需做好环境消毒，玩具、餐具等物品定期清洁。流行季节避免带儿童去人群密集场所。发现患儿应及时隔离，对其分泌物、排泄物进行消毒处理。保持室内空气流通，注意营养均衡，适当锻炼有助于增强儿童免疫力。如出现持续高热、精神萎靡等重症表现，应立即就医。