病毒性腹泻与细菌性腹泻的区别主要在于病原体类型、症状特征及治疗方式。病毒性腹泻多由轮状病毒、诺如病毒等引起，表现为水样便、低热；细菌性腹泻常由大肠杆菌、沙门氏菌等导致，多见黏液脓血便、高热。两者在传播途径、病程及用药选择上均有差异。
病毒性腹泻通常起病急骤，粪便呈稀水样，可能伴随轻度发热或呕吐，儿童更易出现脱水症状。轮状病毒感染多见于婴幼儿，诺如病毒则常引起群体性暴发。此类腹泻具有自限性，一般3-7天可自愈，治疗以补液为主，无须使用抗生素。
细菌性腹泻常见腹痛明显，粪便中混有黏液或血丝，体温常超过38.5摄氏度。志贺菌感染可引发里急后重感，霍乱弧菌会导致米泔水样便。这类腹泻需通过粪便培养确诊，治疗需根据药敏结果选用敏感抗生素，如左氧氟沙星片、头孢克肟颗粒等，同时需严格隔离防止传播。
无论病毒性或细菌性腹泻，均需注意补充电解质溶液预防脱水，发病期间选择米汤、面条等低渣饮食。细菌性腹泻患者餐具应煮沸消毒，病毒性腹泻需加强手卫生。若出现持续高热、血便或意识模糊等症状，须立即就医。日常应注意食物充分加热，避免生熟食交叉污染，婴幼儿可接种轮状病毒疫苗进行预防。