儿童鞘膜积液手术后可能出现阴囊肿胀、切口感染、复发等后遗症，但多数症状轻微且可逆。
阴囊肿胀是术后常见现象，与局部淋巴回流受阻有关，通常1-2周内自行消退。切口感染多因护理不当导致，表现为红肿渗液，需及时消毒换药。复发概率较低，多见于交通性鞘膜积液未完全结扎的情况。极少数患儿可能出现睾丸血供受影响，需通过超声检查评估。术后疼痛一般3天内缓解，可通过冰敷减轻不适。
特殊情况下可能发生鞘膜腔粘连，影响睾丸活动度。先天性腹股沟管发育异常者术后易出现同侧腹股沟疝。过敏体质儿童可能对缝合线产生排斥反应。全身麻醉相关风险如恶心呕吐多24小时内消失。长期随访中极个别病例报告睾丸萎缩，与术中精索血管损伤相关。
术后应保持会阴清洁干燥，避免剧烈运动2-4周，穿着宽松棉质内裤减少摩擦。饮食宜清淡富含优质蛋白，如鱼肉、蒸蛋等促进伤口愈合。定期复查超声监测睾丸发育情况，发现阴囊持续增大或硬结及时就诊。避免长时间坐卧压迫手术区域，可适当抬高阴囊减轻水肿。术后1个月内禁止游泳、骑跨类活动，遵医嘱使用抗生素预防感染。