补过的牙齿仍然可能发生蛀牙。补牙材料与牙齿边缘可能因微渗漏或老化出现缝隙，导致细菌侵入引发继发龋。
补牙后发生蛀牙主要与修复体边缘微渗漏有关。补牙材料如树脂或银汞合金与牙齿结合处可能因长期咀嚼压力产生微小裂隙，食物残渣和细菌容易在此堆积。若日常口腔清洁不彻底，细菌代谢产酸会腐蚀牙齿组织，形成继发龋。补牙材料本身不会龋坏，但相邻的天然牙体仍可能被侵蚀。
少数情况下，若原有龋坏组织未彻底清除或补牙时操作不规范，可能导致龋齿在修复体下方继续发展。糖尿病患者、唾液分泌减少者等特殊人群，因口腔环境改变更易出现继发龋。儿童乳牙补牙后因牙釉质较薄，也需加强防护。
建议补牙后每6个月进行口腔检查，使用含氟牙膏配合牙线清洁修复体边缘，避免咀嚼过硬食物。儿童可进行窝沟封闭，老年人需关注牙龈退缩导致的根面龋风险。出现修复体脱落、边缘发黑或冷热敏感时应及时就诊，通过X光检查可早期发现隐匿性龋坏。