扁桃体摘除的利弊需根据患者个体情况判断，对于反复发作的化脓性扁桃体炎或阻塞性睡眠呼吸暂停患者，手术获益通常大于风险；而对于免疫功能低下或存在出血倾向者，手术可能弊大于利。
扁桃体摘除能有效消除慢性感染病灶，降低咽喉部反复炎症发作概率，改善睡眠呼吸障碍患者的通气功能。术后可能减少抗生素使用频率，缓解因扁桃体肥大导致的吞咽困难或发音异常。手术采用全身麻醉，技术成熟且并发症概率较低，多数患者术后1-2周可恢复日常饮食。
手术存在创面出血、麻醉意外等短期风险，术后可能出现暂时性咽痛、耳部放射痛等不适。部分患者远期可能出现代偿性舌扁桃体增生或咽干症状。儿童患者需评估手术对免疫系统发育的潜在影响，免疫功能异常者术后感染风险可能增加。
术后建议选择温凉流质饮食2-3天，逐步过渡至软食，避免辛辣刺激性食物。保持口腔清洁，使用生理盐水漱口每日4-6次。术后2周内避免剧烈运动，监测体温及出血情况。恢复期出现持续发热或大量出血需立即就医。日常加强体育锻炼，保持室内空气湿润，预防上呼吸道感染。