小儿颅内肿瘤预后差异较大，主要取决于肿瘤类型、位置、分期及治疗时机。低级别胶质瘤、室管膜瘤等经过规范治疗后5年生存率较高，而髓母细胞瘤、高级别胶质瘤等预后相对较差。
低级别胶质瘤如毛细胞型星形细胞瘤，手术完全切除后10年生存率可达较高水平，部分患儿甚至无须辅助治疗。室管膜瘤患儿若肿瘤位于幕下且未扩散，经手术联合放疗后5年生存率较为理想。髓母细胞瘤对放化疗敏感，但高风险组患儿易复发，需采用强化治疗方案。高级别胶质瘤如胶质母细胞瘤进展迅速，即使采用手术联合放化疗，中位生存期仍较短。生殖细胞肿瘤中，纯生殖细胞瘤对放疗极敏感，5年生存率较高，而非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤预后较差。
部分患儿因肿瘤累及脑干、丘脑等关键部位无法完全切除，或确诊时已发生脑脊液播散，预后会显著恶化。治疗相关并发症如放射性脑坏死、内分泌功能障碍等也可能影响长期生存质量。分子分型逐渐成为预后评估的重要指标，例如具有MYC扩增的髓母细胞瘤复发风险显著增高。新生儿及婴幼儿因治疗耐受性差，预后常不如年长儿。少数患儿会出现继发性恶性肿瘤等远期后遗症。
建议家长定期带患儿进行神经系统检查、头颅影像学复查和内分泌评估，监测肿瘤复发及生长发育情况。治疗期间需保证充足营养支持，必要时进行康复训练改善运动或认知功能障碍。避免剧烈运动或头部外伤，按医嘱完成后续放化疗周期。关注患儿心理状态，可通过游戏治疗等方式缓解焦虑。若出现头痛呕吐、视力变化或行为异常等症状需立即就医。