阴茎疼痛可能由外伤、感染、泌尿系统疾病、神经病变或心理因素引起，可通过药物治疗、物理治疗或手术干预缓解。常见原因包括包皮龟头炎、尿道炎、前列腺炎、阴茎硬结症及慢性盆腔疼痛综合征等。
1、外伤因素
阴茎受到撞击、挤压或性生活过度可能导致局部组织损伤，表现为红肿、淤血或持续性刺痛。轻微外伤可通过冷敷缓解，严重挫伤伴随血肿形成时需就医排除海绵体破裂。
2、感染性疾病
包皮龟头炎常见白色念珠菌感染，伴随白色分泌物和灼热感，可外用克霉唑乳膏。淋球菌性尿道炎会产生黄色脓性分泌物，需注射头孢曲松钠。生殖器疱疹复发时出现簇集水疱，口服阿昔洛韦片可缩短病程。
3、泌尿系统病变
急性前列腺炎引发会阴部放射痛，伴随排尿困难，左氧氟沙星片对细菌性感染有效。尿道结石嵌顿会导致排尿中断和刀割样疼痛，体外冲击波碎石可解除梗阻。膀胱过度活动症引起的牵扯痛可通过索利那新片改善。
4、器质性疾病
阴茎硬结症在勃起时出现弯曲和剧痛，胶原酶溶组织梭菌注射可软化斑块。佩罗尼氏病进展期需手术矫正。慢性盆腔疼痛综合征与神经敏化有关，加巴喷丁胶囊能调节神经传导。
5、心因性因素
焦虑抑郁导致的躯体化疼痛常表现为游走性刺痛，认知行为治疗联合帕罗西汀片可改善症状。长期手淫后的负罪感可能放大痛觉感知，需进行性心理疏导。
日常应避免穿过紧内裤减少摩擦，性生活前后注意清洁，每日饮水保持2000毫升以上稀释尿液。出现持续疼痛超过3天、伴随血尿或发热时须立即就诊泌尿外科，禁止自行服用止痛药掩盖症状。定期进行前列腺特异性抗原筛查可早期发现恶性病变。