原发性卵巢绒癌预后差异较大，早期发现并规范治疗的患者5年生存率较高，晚期或治疗不规范者预后较差。预后主要与肿瘤分期、治疗方案、患者年龄及病理类型等因素相关。
肿瘤分期是影响预后的核心因素。国际妇产科联盟分期中，Ⅰ期患者通过手术联合化疗后5年生存率较高，肿瘤局限于单侧卵巢且无转移时治愈概率显著提升。Ⅱ期以上患者随着肿瘤扩散范围扩大，生存率逐步下降，尤其发生肝、脑等远处转移的Ⅳ期患者预后极差。
规范化疗方案可改善预后。以依托泊苷联合顺铂为主的化疗方案对绒癌高度敏感，及时足疗程治疗可使部分晚期患者获得长期生存。但化疗耐药或复发患者预后急剧恶化，需采用二线方案如紫杉醇联合异环磷酰胺等挽救治疗。手术彻底切除病灶对早期患者至关重要，残留病灶会增加复发风险。
患者确诊后应尽早在妇科肿瘤专科就诊，通过血清人绒毛膜促性腺激素动态监测评估疗效。治疗期间需加强营养支持，优先选择高蛋白、高维生素食物如鱼肉、蛋类及新鲜蔬菜水果，避免辛辣刺激饮食。保持规律作息与适度运动有助于提升免疫功能，但应避免剧烈运动防止肿瘤破裂出血。治疗后需终身随访，前2年每3个月复查肿瘤标志物及影像学，5年内无复发可视为临床治愈。出现异常阴道出血、腹痛等症状需立即就医。