孕妇一般可以使用益生菌，有助于调节肠道菌群平衡，但需在医生指导下选择适宜菌株。
益生菌对孕妇的潜在益处主要体现在改善消化功能方面。孕期激素变化可能导致胃肠蠕动减慢，部分孕妇会出现便秘或腹胀。特定益生菌株如双歧杆菌、乳酸杆菌等可通过抑制有害菌生长，促进短链脂肪酸产生，帮助缓解这些症状。某些研究还提示益生菌可能通过调节免疫平衡，降低妊娠期糖尿病、过敏性疾病的发生概率。选择益生菌时需注意菌株安全性，部分菌株如鼠李糖乳杆菌GG株、嗜酸乳杆菌LA-5等具有较充分的孕妇使用数据。
虽然益生菌总体安全性较高，但孕妇使用时仍需谨慎。免疫功能异常、存在中心静脉导管或心脏瓣膜病变的孕妇应避免使用，以防发生菌血症风险。部分益生菌产品可能含有不适合孕妇的添加剂，如某些酵素或膳食纤维成分。极少数情况下可能出现轻微不良反应如胃肠不适，若出现持续腹泻或腹痛应停用。不建议孕妇自行购买未明确标注孕期安全性的益生菌产品，尤其需避免含活菌数过高的非正规制剂。
孕妇使用益生菌期间应保持饮食均衡，适量摄入富含膳食纤维的蔬菜水果和全谷物，避免高脂高糖饮食影响益生菌定植效果。注意观察排便情况及有无过敏反应，避免与抗生素同服。建议选择有明确菌株编号、活菌数稳定的正规产品，开封后需冷藏保存并在保质期内使用。若存在先兆流产、妊娠剧吐等特殊情况，或正在服用免疫抑制剂等药物，使用前必须咨询产科医生。日常可通过无糖酸奶等天然发酵食品补充益生菌，但需控制每日乳制品摄入量不超过推荐标准。