新生儿肠扭转手术存在一定风险，但多数情况下通过及时干预可有效控制。肠扭转可能由先天性肠旋转不良、肠系膜固定异常等因素引起，需紧急处理以避免肠坏死等严重并发症。
新生儿肠扭转手术的风险主要与患儿基础状况和病情进展速度相关。早产儿或低体重儿因器官发育不完善，对手术耐受性较差，可能出现麻醉意外或术后感染。术中需精确判断肠管活力，若扭转时间超过6小时未解除，易发生肠管缺血坏死，需切除病变肠段，影响营养吸收功能。术后可能出现吻合口瘘、腹腔粘连等并发症，需密切监测生命体征和腹部体征变化。
少数情况下，若合并严重先天性心脏病或肺部疾病，手术风险显著增加。极低出生体重儿术后可能出现坏死性小肠结肠炎，需长期肠外营养支持。遗传代谢异常患儿对麻醉药物敏感度异常，可能诱发代谢危象。但现代新生儿外科技术已能通过微创手术降低创伤，配合围术期监护可大幅提升安全性。
术后需保持患儿温暖，采用少量多次的喂养方式，首选母乳或深度水解配方奶。家长应记录每日排便次数和性状，观察有无呕吐、腹胀等情况。定期随访评估生长发育指标，必要时进行胃肠造影检查。避免剧烈晃动患儿腹部，按医嘱使用益生菌制剂调节肠道菌群。如发现喂养不耐受或体重增长缓慢，需及时返院复查。