黄芪和黄芩是两种不同的中药材，黄芪为补气药，黄芩为清热药，二者在来源、性味归经、功效主治等方面均有明显差异。
1、来源不同
黄芪为豆科植物蒙古黄芪或膜荚黄芪的干燥根，主产于山西、甘肃等地。黄芩为唇形科植物黄芩的干燥根，主产于河北、内蒙古等地。
2、性味归经不同
黄芪味甘，性微温，归脾、肺经。黄芩味苦，性寒，归肺、胆、脾、大肠、小肠经。
3、功效不同
黄芪具有补气升阳、益卫固表、利水消肿、托毒生肌的功效。黄芩具有清热燥湿、泻火解毒、止血、安胎的功效。
4、主治不同
黄芪主要用于气虚乏力、食少便溏、中气下陷、表虚自汗、气虚水肿、痈疽难溃或久溃不敛等。黄芩主要用于湿温暑湿、胸闷呕恶、湿热痞满、泻痢、黄疸、肺热咳嗽、高热烦渴、血热吐衄、痈肿疮毒、胎动不安等。
5、禁忌不同
黄芪表实邪盛、气滞湿阻、食积停滞、痈疽初起或溃后热毒尚盛者禁用。黄芩脾胃虚寒、食少便溏者慎用。
使用黄芪或黄芩前应咨询中医师，根据个人体质和病情辨证用药。黄芪可搭配当归补血，黄芩常与黄连配伍清热。日常服用时需注意药材质量，避免与相克药物同用，服药期间忌食辛辣刺激食物，出现不适及时停用并就医。