金匮肾气丸具有温补肾阳、化气行水的功效，主要用于治疗肾虚水肿、腰膝酸软、小便不利、畏寒肢冷等症状。
1、温补肾阳
金匮肾气丸中的附子、肉桂等成分能温补肾阳，改善肾阳虚引起的畏寒肢冷、腰膝酸软。肾阳虚患者可能出现夜尿频繁、性功能减退，服用后有助于缓解这些症状。但阴虚火旺者禁用，可能加重口干舌燥等不适。
2、化气行水
该药通过茯苓、泽泻等利水渗湿成分促进水液代谢，适用于肾虚导致的水肿、小便不利。临床常见于慢性肾炎或心力衰竭患者，服药后尿量增加，下肢浮肿减轻。需注意电解质平衡监测。
3、改善腰膝症状
熟地黄、山茱萸等补益肝肾的成分可缓解肾虚型腰痛和膝关节无力，常见于中老年退行性骨关节病。长期服用需配合适度运动，避免久坐久站加重骨骼负荷。
4、调节生殖功能
对肾阳虚引起的男性遗精滑泄、女性宫冷不孕有辅助调理作用。其机制可能与改善肾上腺皮质功能有关，但严重生殖系统疾病需结合专科治疗。
5、辅助治疗慢性病
在医生指导下可用于糖尿病肾病、甲状腺功能减退等慢性病的辅助治疗，通过改善基础代谢率缓解病情进展。不可替代主要治疗药物。
服用金匮肾气丸期间应避免生冷饮食，适量食用羊肉、韭菜等温补类食物，配合八段锦等舒缓运动增强疗效。长期使用需定期复查肝肾功能，出现口干、心悸等不良反应应及时停药就医。孕妇、实热证患者及感冒发热期间禁用，高血压患者慎用。