甲氨蝶呤治疗宫外孕可能引起胃肠道反应、骨髓抑制、肝功能损害、皮肤黏膜损伤及肾功能异常等副作用。该药物通过抑制细胞增殖发挥作用，需严格在医生指导下使用。
1、胃肠道反应
甲氨蝶呤常见恶心呕吐、口腔溃疡、腹泻等消化道症状，与药物直接刺激胃肠黏膜相关。严重者可出现消化道出血，需配合奥美拉唑肠溶胶囊等胃黏膜保护剂治疗。
2、骨髓抑制
药物可能抑制骨髓造血功能，导致白细胞减少、血小板降低等，表现为感染倾向或出血风险增加。治疗期间需定期监测血常规，必要时使用重组人粒细胞刺激因子注射液。
3、肝功能损害
约30%患者出现转氨酶升高，与药物肝毒性相关。多表现为乏力、食欲减退，严重者可进展为药物性肝炎。需联合复方甘草酸苷片进行保肝治疗。
4、皮肤黏膜损伤
药物可引起皮疹、皮肤瘙痒甚至剥脱性皮炎等过敏反应，口腔及生殖器黏膜易发生溃疡。局部可使用曲安奈德益康唑乳膏缓解症状。
5、肾功能异常
大剂量使用时可能引发血尿、蛋白尿等肾小管损伤，与药物结晶堵塞肾小管有关。治疗期间需充分水化，必要时静脉输注碳酸氢钠注射液碱化尿液。
接受甲氨蝶呤治疗期间应保持清淡饮食，避免辛辣刺激食物加重胃肠道反应；每日饮水2000毫升以上促进药物排泄；严格避孕至血HCG完全转阴；每周复查血常规、肝肾功能及血HCG水平；出现发热、严重腹泻或皮肤黏膜溃烂等症状需立即就医。治疗结束后3个月内建议补充叶酸制剂以减轻药物残留影响。