甲状腺穿刺一般存在一定风险，但严重并发症概率较低。主要风险包括局部出血、感染、喉返神经损伤、甲状腺功能异常及穿刺结果假阴性等。
甲状腺穿刺后局部出血较为常见，多表现为穿刺点轻微渗血或皮下淤青，通常压迫止血后可自行缓解。感染风险与操作环境消毒是否规范相关，可能出现局部红肿热痛，需及时使用抗生素治疗。喉返神经损伤可能导致声音嘶哑或饮水呛咳，多数为暂时性症状，1-3个月可逐渐恢复。穿刺可能刺激甲状腺组织引发短暂性甲亢或甲减，需监测甲状腺功能指标。穿刺结果假阴性可能与取样位置偏差有关，必要时需重复检查或结合超声评估。
极少数情况下可能出现气管损伤导致呼吸困难，或颈部大血管损伤引发血肿压迫，此时需紧急医疗干预。存在严重凝血功能障碍或甲状腺显著充血肿大者风险较高，术前需完善凝血功能检查。穿刺后出现持续颈部肿胀、发热或呼吸困难等症状时，应立即就医处理。
建议穿刺前完善甲状腺超声和凝血功能检查，选择正规医疗机构由经验丰富的医师操作。术后需按压穿刺点15-20分钟，24小时内避免颈部剧烈活动，观察有无声音改变、吞咽困难等异常。保持穿刺部位清洁干燥，3天内避免沾水。若出现心慌、手抖等甲亢症状或乏力、畏寒等甲减表现，应及时复查甲状腺功能。日常注意碘盐适量摄入，避免频繁触摸或挤压甲状腺区域，定期复查超声监测甲状腺结节变化。