甲状腺乳头状癌术后存在复发可能，复发概率与肿瘤分期、手术范围、术后管理等因素相关。复发形式主要有局部淋巴结转移、残留甲状腺复发、远处转移三种。
甲状腺乳头状癌复发多与初次手术切除不彻底有关。肿瘤突破包膜侵犯周围组织时，局部残留病灶可能成为复发源。术后未规范进行放射性碘治疗或促甲状腺激素抑制治疗，也可能增加复发风险。复发常见于术后5年内，但晚期复发案例亦有报道。
远处转移是预后较差的表现，肺部和骨骼是常见转移部位。这类患者需通过全身放射性碘扫描定位病灶，结合血清甲状腺球蛋白监测病情。多学科协作治疗模式对控制转移灶进展有重要意义，可能涉及二次手术、外照射治疗或靶向药物应用。
术后患者应坚持每6-12个月复查颈部超声和甲状腺功能，监测促甲状腺激素水平维持在0.1-0.5mIU/L。日常需避免颈部外伤，保持均衡饮食并适量补充维生素D。出现声音嘶哑、颈部肿块或骨痛等症状时应及时就诊。规律作息和情绪管理有助于维持免疫系统功能，降低复发风险。