药物流产对身体可能造成一定危害，但多数情况下危害可控。药物流产的危害程度与个体体质、用药规范性和术后护理等因素有关。
药物流产通过服用米非司酮片和米索前列醇片等药物终止妊娠，可能引起阴道出血、腹痛、恶心呕吐等药物反应。这些症状通常在流产后1-2周内逐渐减轻，出血量多时可达到月经量的2-3倍。部分女性可能出现头晕乏力等贫血表现，需注意补充铁剂和蛋白质。药物流产成功率约为90-95%，但存在5-10%的概率需要清宫手术处理残留组织。
少数情况下可能出现严重并发症如大出血、感染或药物过敏反应。流产后子宫收缩不良可能导致出血时间延长，超过3周需就医检查。宫腔感染可能引起发热、分泌物异常和下腹疼痛，需使用抗生素治疗。对前列腺素类药物过敏者可能出现皮疹、呼吸困难等过敏反应，应立即停药就医。存在宫外孕未排除或长期使用糖皮质激素者禁止药物流产。
药物流产后应卧床休息2-3天，1个月内避免剧烈运动和重体力劳动，保持会阴清洁并禁止盆浴。饮食上多摄入瘦肉、动物肝脏等含铁食物，配合新鲜蔬菜水果促进铁吸收。术后2周复查超声确认流产是否完全，严格遵医嘱使用益母草颗粒等促子宫恢复药物。流产后卵巢功能通常在3-6周恢复，需做好避孕措施避免短期再次妊娠。出现发热、持续腹痛或出血量超过平时月经量2倍时应及时就诊。