疱疹性咽峡炎具有传染性，主要通过飞沫传播、接触传播及粪口传播。疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的急性上呼吸道感染性疾病，常见于儿童。
疱疹性咽峡炎的传染源为患者及隐性感染者，病毒可通过呼吸道分泌物、疱疹液及粪便排出体外。发病初期传染性最强，患者在出现发热、咽痛等症状时已具备传染能力。接触被病毒污染的玩具、餐具等物品后未及时洗手，或与患者共用餐具、毛巾等个人用品，均可能造成感染。婴幼儿因免疫系统发育不完善，更易被传染。
部分成人感染肠道病毒后可能无明显症状，但仍具有传染性。孕妇若感染柯萨奇病毒，可能通过胎盘或分娩过程传染给新生儿。免疫功能低下者感染后病毒排出时间可能延长，传染期相应延长。托幼机构、学校等儿童密集场所易发生聚集性疫情，需加强通风消毒与病例隔离。
预防疱疹性咽峡炎需注意个人卫生，勤洗手并避免用手接触口鼻。患者应居家隔离至症状完全消失，餐具、毛巾等个人物品需单独使用并煮沸消毒。流行期间避免前往人群密集场所，儿童玩具、门把手等高频接触物体表面需定期用含氯消毒剂擦拭。保持室内空气流通，合理膳食并保证充足睡眠有助于增强免疫力。若家庭成员出现发热、咽部疱疹等症状，应及时就医并做好隔离防护。