肛门外没有尖锐湿疣时，肛门内仍可能出现感染。尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒引起的性传播疾病，可同时或单独发生于肛门内外黏膜。
尖锐湿疣的传播主要通过皮肤黏膜接触，肛门内感染可能因肛交行为或病毒从外阴区域扩散导致。肛门内黏膜潮湿环境更利于病毒存活，即使外部未见疣体，内部仍可能因病毒潜伏感染而出现病变。部分患者因肛门内神经分布较少，早期可能无明显症状，需通过肛门镜才能发现微小疣体。
少数情况下，免疫功能低下者可能出现肛门内孤立性疣体，此时外部皮肤仍保持正常。长期未治疗的肛门内尖锐湿疣可能增大并引起排便疼痛、出血等症状，需通过病理活检与肛门鳞状细胞癌鉴别。
建议保持会阴部清洁干燥，避免高危性行为，使用避孕套可降低传染风险。若发现肛门不适或异常增生，应及时至皮肤性病科或肛肠科就诊，通过醋酸白试验、HPV检测等方式明确诊断。已确诊者应遵医嘱采用激光、冷冻或光动力治疗，并定期复查防止复发。配偶及性伴侣需同步检查，治疗期间禁止性生活。