破伤风针可能导致局部红肿疼痛、发热、过敏反应等不良反应，严重时可能出现神经系统症状，但发生率较低。
破伤风针注射后常见局部红肿、硬结或疼痛，通常1-3天自行缓解。部分人群可能出现37.5-38.5℃低热，伴有乏力、食欲减退等全身反应。少数过敏体质者可能发生皮疹、瘙痒等过敏症状，极个别会出现过敏性休克。破伤风抗毒素含异种蛋白，可能诱发血清病样反应，表现为关节痛、淋巴结肿大等症状。疫苗中的铝佐剂可能导致注射部位形成皮下结节，持续数周至数月。
神经系统并发症如臂丛神经损伤、吉兰-巴雷综合征等较为罕见，多与注射操作或个体特殊体质相关。免疫功能缺陷者可能出现疫苗无效或异常免疫反应。孕妇接种需评估获益风险比，哺乳期妇女接种不影响哺乳。既往有破伤风疫苗严重不良反应史者应禁用。
接种后应留观30分钟监测过敏反应，24小时内避免剧烈运动或揉搓注射部位。出现持续高热、呼吸困难、严重肿胀等情况需及时就医。日常保持伤口清洁干燥，深度污染伤口需联合免疫球蛋白注射。定期接种破伤风疫苗可建立长期保护，成人建议每10年加强接种一次。接种前后避免饮酒及辛辣饮食，过敏体质者需提前告知医生。