激光点痣可能出现色素沉着、感染、瘢痕形成、复发、灼伤等危害。激光点痣是利用激光能量破坏痣细胞的方法，需由专业医生操作以降低风险。
激光点痣后局部皮肤可能出现暂时性色素沉着，与个人体质或术后护理不当有关，通常数月内逐渐消退。术后未保持创面清洁可能引发感染，表现为红肿、渗液，需及时消毒或使用抗生素软膏如莫匹罗星软膏。瘢痕体质者可能形成增生性瘢痕，早期可通过硅酮凝胶敷料预防。部分痣细胞未被彻底清除可能导致复发，需二次处理。操作不当可能因能量过高导致皮肤灼伤，出现水疱或表皮坏死，需立即冷敷并就医。
特殊情况下，激光刺激可能激活少数交界痣的恶变潜能，但概率极低。眼周等特殊部位操作失误可能损伤角膜或眼睑功能，需由经验丰富的医生实施。对光敏感或正在服用光敏药物者可能出现异常光毒性反应，术前应充分告知医生用药史。
激光点痣后需保持创面干燥，避免搔抓或接触污染物，3天内不要沾水。外出时严格防晒，使用物理遮挡或SPF30以上防晒霜。饮食宜清淡，避免辛辣刺激食物。术后1周复查观察恢复情况，若出现异常疼痛、化脓或持续红肿应及时就医。恢复期间避免使用化妆品或剧烈运动，防止摩擦创面。