肛瘘术后复发可通过观察局部红肿渗液、持续疼痛或发热等症状初步判断，确诊需结合肛门指诊、超声或MRI检查。
肛瘘手术后复发早期可能仅表现为轻微肛门不适或潮湿感，容易被忽视。随着病情进展，原手术切口周围可能出现红肿、压痛，按压时有脓性分泌物渗出，部分患者可触及皮下条索状硬结。若感染加重，可能伴随发热、乏力等全身症状。术后3-6个月内是复发高发期，但少数患者在术后数年仍可能复发。
复发风险与肛瘘类型密切相关。单纯性低位肛瘘复发概率较低，复杂性高位肛瘘因瘘管走行曲折、分支多，易出现清创不彻底。合并克罗恩病、糖尿病等基础疾病者，组织修复能力差，复发风险显著增加。术中未准确找到内口或未充分引流，也是常见复发原因。
术后应保持肛门清洁干燥，每日用温水坐浴2-3次，每次10-15分钟；避免久坐久站，规律进行提肛运动；饮食以高纤维食物为主，如燕麦、西蓝花等，预防便秘；发现异常及时复查，术后1年内每3个月需进行肛门指诊。若确诊复发，可根据情况选择挂线疗法、激光瘘管闭合术或二次手术，合并感染时需配合头孢克肟分散片、甲硝唑片等抗生素治疗。