孕妇结膜炎一般可在医生指导下使用特定眼药水，但需严格避免含激素或抗生素的禁忌药物。
孕妇结膜炎治疗需优先选择安全性高的药物，如人工泪液或医生处方的抗过敏眼药水。人工泪液不含药物成分，仅通过物理润滑缓解干涩和异物感，适合轻症患者使用。对于过敏性结膜炎，医生可能推荐色甘酸钠滴眼液等抗组胺药物，这类药物局部吸收量极少且无致畸风险。细菌性结膜炎需谨慎使用抗生素类眼药水，如确需使用，医生会选择红霉素眼膏等孕期相对安全的药物。病毒性结膜炎通常以冷敷等物理疗法为主，必要时使用更昔洛韦滴眼液等抗病毒药物需严格评估利弊。
含氟喹诺酮类或氨基糖苷类抗生素的眼药水可能影响胎儿发育，应绝对避免。含地塞米松等激素成分的眼药水可能干扰胎儿生长，除非危及视力且无替代方案时才会在严密监测下使用。部分中成药眼药水未明确孕期安全性，如珍珠明目滴眼液等需避免自行使用。若结膜炎伴随发热、视力下降或脓性分泌物增多，需立即就医而非自行用药。
孕妇出现结膜炎症状时应先就诊眼科和产科，用药前需核对药品说明书中的妊娠分级，避免揉眼并保持眼部清洁。可冷敷缓解红肿痒痛，保证充足睡眠有助于免疫调节。饮食上增加维生素A和维生素C的摄入，如胡萝卜和柑橘类水果，但需注意过敏体质者避免接触已知过敏原。日常避免长时间用眼，减少隐形眼镜佩戴，室内保持适宜湿度以减少刺激。