圣女果泡水裂开后若未变质通常可以食用，但出现异味、变色或发霉时需丢弃。
圣女果表皮裂开可能是由于吸水膨胀导致果肉与果皮分离，属于物理性损伤。若裂开后未超过2小时且储存环境清洁干燥，果肉未暴露于空气中过久，微生物污染风险较低，去除裂口周围软化部分后仍可安全食用。裂口处果肉因接触水分可能出现局部变软或颜色变浅，但不影响其他未受损部分的营养价值。
若圣女果裂开后置于潮湿环境超过4小时，或伴随果肉渗出黏液、散发酸腐味、表皮出现黑斑或白霉，则表明已发生微生物污染或霉变。此时果肉中可能滋生霉菌毒素或致病菌，食用后可能引发胃肠不适甚至食物中毒。尤其需注意裂口处若呈现明显褐变或腐烂扩散至果蒂部位，提示变质程度严重，应整颗丢弃。
日常储存圣女果时应保持表面干燥，避免长时间浸泡。可先用厨房纸吸干水分后放入透气的保鲜盒，置于冰箱冷藏室5-8℃保存。食用前用流动清水冲洗表面，剔除有裂痕或软化的个体。若需制作沙拉等即食菜品，建议现洗现切，避免预先浸泡。对于婴幼儿及免疫力低下人群，建议优先选择完整无破损的新鲜圣女果，去皮后食用更安全。发现储存的圣女果表皮出现褶皱或光泽度下降时，应尽快食用完毕，此时维生素C等水溶性营养素已开始流失。