长期煮灵芝水喝可能对身体有害，过量或不当饮用可能引起胃肠不适、肝功能异常等问题。
灵芝作为传统滋补品，含有多种活性成分如多糖、三萜类化合物等，适量饮用可能有助于调节免疫力。但长期大量煮灵芝水饮用可能导致胃肠黏膜刺激，出现腹胀、腹泻等症状。部分人群对灵芝成分敏感，可能出现皮肤瘙痒、皮疹等过敏反应。灵芝中的某些成分需经肝脏代谢，长期过量摄入可能增加肝脏负担。灵芝可能影响凝血功能，与抗凝药物同服时需谨慎。
建议每周饮用灵芝水不超过3次，每次用量控制在5-10克干灵芝为宜。饮用前可咨询中医师辨证体质，避免与西药同服。出现恶心、头晕等不适时应立即停用。孕妇、儿童、术后患者等特殊人群应避免自行服用。日常保存灵芝需防潮避光，煮水时建议搭配红枣、枸杞等缓和药性。保持饮食均衡，避免单一依赖灵芝水保健。