飞蚊症初期通常可以治好，多数患者通过玻璃体消融术或药物干预可改善症状，但部分生理性飞蚊症可能无须治疗。
飞蚊症初期若由玻璃体混浊引起，可采用玻璃体消融术利用激光分解混浊物，术后配合卵磷脂络合碘片、氨碘肽滴眼液等药物促进吸收。部分患者因视网膜裂孔导致飞蚊症，需及时行视网膜激光封堵术防止视网膜脱离，术后联合使用七叶洋地黄双苷滴眼液缓解视疲劳。对于葡萄膜炎引发的飞蚊症，需使用醋酸泼尼松龙滴眼液控制炎症，配合复方血栓通胶囊改善微循环。糖尿病患者出现飞蚊症时，需在控制血糖基础上使用羟苯磺酸钙胶囊减少血管渗漏。高度近视患者发生的飞蚊症，建议避免剧烈运动并使用玻璃酸钠滴眼液保持眼表湿润。
生理性飞蚊症多见于中老年玻璃体液化，若无视力下降可观察随访，日常补充叶黄素酯可能减缓进展。外伤后玻璃体积血导致的飞蚊症，急性期需静卧并使用云南白药胶囊止血，后期若未吸收需行玻璃体切割术。部分先天性玻璃体异常引起的飞蚊症状可能伴随终生，但通常不影响视力。极少数脉络膜黑色素瘤早期表现为飞蚊症，需通过超声检查排除。长期使用激素类药物者若突发飞蚊症，需警惕玻璃体后脱离引发的视网膜病变。
飞蚊症患者应避免长时间用眼，每用眼40分钟休息5分钟并远眺，保持环境光线柔和。饮食上增加蓝莓、菠菜等富含花青素的食物，控制高糖高脂饮食以防加重眼底病变。高度近视者需每年检查眼底，避免跳水、蹦极等剧烈运动。出现闪光感、视野缺损等伴随症状时须立即就医。建议选择防蓝光眼镜减少电子屏幕刺激，适度热敷促进眼周血液循环，但避免直接按压眼球。保持规律作息和情绪稳定有助于控制症状进展。