甲状腺功能减退通常不会直接转变为甲状腺功能亢进，但两者可能因治疗不当或自身免疫疾病交替出现。
甲状腺功能减退与甲状腺功能亢进是两种不同的甲状腺激素分泌异常状态。甲状腺功能减退患者若接受过量左甲状腺素钠片治疗，可能出现药物性甲状腺功能亢进，表现为心悸、多汗、体重下降等症状。部分桥本甲状腺炎患者早期可能出现短暂甲状腺功能亢进期，后期转为甲状腺功能减退。妊娠期甲状腺功能异常也可能出现两种状态的交替变化。放射性碘治疗格雷夫斯病后，部分患者会从甲状腺功能亢进转为甲状腺功能减退。
极少数情况下，甲状腺癌术后患者因残留甲状腺组织过度代偿，可能发生甲状腺功能亢进。某些甲状腺炎如亚急性甲状腺炎、无痛性甲状腺炎，疾病不同阶段可分别出现甲状腺功能亢进和甲状腺功能减退表现。甲状腺激素抵抗综合征等罕见疾病也可能导致两种状态并存。
甲状腺疾病患者应定期监测促甲状腺激素和游离甲状腺素水平，避免自行调整药物剂量。日常需保持均衡饮食，适量摄入海带等含碘食物但不宜过量，规律作息有助于维持甲状腺功能稳定。出现心慌、手抖、体重骤变等异常症状时需及时就医复查，医生会根据检查结果调整治疗方案。长期服用左甲状腺素钠片者需注意与其他药物间隔4小时服用，避免影响吸收。