早上制作的豆浆在妥善保存的情况下晚上可以饮用。豆浆变质主要与储存温度、时间及容器密封性有关，建议冷藏保存不超过12小时。
豆浆富含植物蛋白和多种营养素，但也是微生物理想的培养基。若室温存放超过4小时，细菌可能大量繁殖导致酸败变质。冷藏环境下细菌繁殖速度减缓，密封保存的豆浆在5℃以下可延长保质期至12小时。饮用前需观察是否有絮状沉淀、酸味或异味，出现这些现象则不可饮用。加热至沸腾能杀灭部分细菌，但无法消除已产生的毒素，变质豆浆即使加热也不建议食用。
夏季高温环境或开封后未密封的豆浆更容易变质，这类情况下即使冷藏也不建议隔夜饮用。使用玻璃或陶瓷容器盛装比塑料容器更利于保鲜。部分人群胃肠功能较弱，饮用隔夜冷藏豆浆可能出现不适，建议现制现饮。
日常饮用豆浆建议控制单次制作量，2小时内饮用完毕最佳。剩余豆浆应立即倒入密封容器，冷却至室温后放入冰箱冷藏区保存，不可置于冰箱门架等温度波动大的位置。搭配谷物类食物可提高蛋白质吸收率，但不宜与红霉素等抗生素同服。大豆过敏者、痛风急性发作期患者应避免饮用，胃肠功能欠佳者可选择少量多次饮用温热的新鲜豆浆。