蛋白过敏通常不需要停母乳，母乳喂养期间母亲需严格回避牛奶蛋白等过敏原。若婴儿症状持续或加重，可在医生指导下尝试深度水解配方奶粉或氨基酸配方奶粉替代。
母乳是婴儿最理想的天然食物，含有丰富的免疫活性物质和营养素，有助于降低过敏风险。多数蛋白过敏婴儿在母亲回避牛奶、鸡蛋、大豆等常见过敏原后，症状可逐渐缓解。母亲需记录饮食日记，观察婴儿反应，避免摄入含隐藏过敏原的加工食品。
少数婴儿对母乳中微量过敏原仍存在严重反应，表现为反复湿疹、便血、呕吐或生长发育迟缓。此时需由儿科医生评估是否需暂停母乳，改用特殊医学用途配方粉。深度水解配方奶粉将牛奶蛋白分解为小分子肽段，氨基酸配方奶粉则完全不含完整蛋白，均可作为安全替代方案。
哺乳期母亲应保持均衡饮食，确保钙和维生素D的摄入，必要时在医生指导下补充营养素。定期监测婴儿体重增长曲线和过敏症状变化，避免盲目使用羊奶或豆奶等替代品。引入辅食时遵循单一品种、少量开始原则，优先选择低敏食物如米粉、苹果泥。若出现可疑过敏反应，及时就医进行过敏原检测，由专科医生制定个体化喂养方案。