智齿长在肉里面通常需要手术拔除，这类智齿称为阻生智齿，可能因空间不足或生长方向异常导致牙龈覆盖。拔除方式主要有切开牙龈、去除部分骨组织、分割牙齿后分块取出等步骤。
阻生智齿拔除前需拍摄口腔X光片或锥形束CT，明确牙齿位置与邻近神经血管的关系。手术通常在局部麻醉下进行，医生会先切开覆盖智齿的牙龈组织，暴露牙冠。若存在骨阻挡，需用高速手机磨除部分牙槽骨。对于横向或倒置生长的智齿，常采用分牙术将牙齿分割成2-3块后逐一取出。术后需缝合创口并放置止血棉球，整个过程约30-60分钟。
复杂阻生智齿可能伴随邻近磨牙牙根吸收、颌骨囊肿等并发症，此时需联合超声骨刀或显微外科技术精细操作。完全骨埋伏的低位水平阻生齿拔除难度较高，可能需住院全麻下完成。术后可能出现暂时性下唇麻木、张口受限等情况，多数在1-3个月内恢复。
阻生智齿拔除后24小时内避免漱口和剧烈运动，进食温凉流质食物，用对侧牙齿咀嚼。术后48小时可开始含漱氯己定含漱液预防感染，按医嘱服用布洛芬缓释胶囊缓解疼痛。拆线前避免吸烟饮酒，保持口腔卫生但勿用力刷手术区。若出现持续出血、剧烈疼痛或发热，应及时复诊。恢复期间建议补充维生素C泡腾片促进伤口愈合，2周内避免吹奏乐器等需张口大的活动。