肠镜检查一般需要10-30分钟，过程中可能因肠管充气或牵拉产生轻度不适，但多数人可耐受。
肠镜检查时间主要取决于肠道准备情况和检查目的。普通筛查性肠镜通常在10-20分钟内完成，若发现息肉需切除或进行活检，可能延长至20-30分钟。检查前需服用清肠药物排空肠道，此过程约需4-6小时。检查时医生会将带有摄像头的软管经肛门插入，逐步观察直肠、结肠至回盲部的黏膜状态。肠镜导管直径约1厘米，在通过肠道弯曲部位时可能引发短暂胀痛，但现代肠镜设备已显著改善舒适度。检查过程中可配合医生指令调整呼吸和体位，必要时可选择无痛肠镜技术。
检查前3天应进食低渣饮食，避免红色食物影响观察，检查当天需严格禁食。术后2小时内避免进食，待麻醉完全消退后再饮水。恢复饮食应从流质逐步过渡到正常，24小时内避免驾驶或高空作业。建议50岁以上人群每5-10年定期筛查，有家族史者应提前至40岁开始检查。若术后出现持续腹痛、便血或发热，应立即返院复查。