尖锐湿疣目前尚无绝对根治不复发的方法，但通过规范治疗和长期管理可显著降低复发概率。主要治疗方式包括物理治疗、药物治疗、免疫调节治疗等。
物理治疗中二氧化碳激光和液氮冷冻是常用手段，可直接清除疣体组织，但需配合后续药物巩固。药物治疗常用鬼臼毒素酊、咪喹莫特乳膏等外用药抑制病毒复制，干扰素凝胶可辅助增强局部免疫。免疫调节治疗如口服胸腺肽肠溶片或注射卡介苗多糖核酸，通过调节全身免疫功能减少复发。治疗后需定期复查并保持患处清洁干燥，避免局部刺激。伴侣需同步筛查治疗，防止交叉感染。
尖锐湿疣治疗后需长期随访观察，建议治疗后3个月内每2周复查1次，3个月后每月复查1次。日常应避免熬夜、酗酒等降低免疫力的行为，穿着宽松棉质内衣减少摩擦，饮食注意补充优质蛋白和维生素增强抵抗力。治疗期间禁止性生活直至皮损完全消退，痊愈后6个月内性生活需使用避孕套防护。若发现新发皮损应及时就医，不可自行处理。