尖锐湿疣可通过物理治疗、药物治疗、光动力治疗、手术治疗及免疫调节治疗等方式根治，具体需根据病情严重程度和个体差异选择方案。
1、物理治疗
冷冻治疗或激光治疗可直接破坏疣体组织。冷冻治疗通过液氮低温使疣体坏死脱落，适用于数量少、体积小的疣体。激光治疗利用高能光束精准汽化病变组织，对周围皮肤损伤较小，但需重复进行。
2、药物治疗
鬼臼毒素酊、咪喹莫特乳膏等外用药物可抑制病毒复制并促进疣体脱落。鬼臼毒素通过阻断细胞分裂发挥作用，需由医生操作涂抹。咪喹莫特可刺激局部免疫反应，患者可自行使用但可能出现皮肤红肿等反应。
3、光动力治疗
将光敏剂涂抹于患处后照射特定波长光源，产生单态氧破坏疣体。该方法对隐蔽部位如尿道口疣体效果显著，治疗过程无创但需避光48小时，可能需多次治疗。
4、手术治疗
高频电刀或剪切术适用于巨大疣体或对其他治疗无效的情况。手术能一次性清除病灶，但创面需护理以防感染，术后可能遗留瘢痕。需配合抗病毒治疗降低复发概率。
5、免疫调节治疗
干扰素注射或口服免疫增强剂可提高机体对HPV病毒的清除能力。干扰素需局部或全身给药，可能引起发热等副作用。该方案常作为辅助治疗与其他方法联用。
治疗后需保持会阴清洁干燥，避免搔抓患处，3-6个月内禁止性生活以防止交叉感染或复发。日常应增强免疫力，适当补充优质蛋白和维生素，规律作息，减少烟酒摄入。配偶或性伴侣需同步检查，确诊后须共同治疗。治疗后第1年每3个月复查一次，观察是否有新发皮损。若出现复发迹象应及时就医，早期干预可提高根治成功率。