新生儿心率低能否恢复需结合具体病因判断。多数情况下经及时干预可恢复正常，少数严重病因可能导致不可逆损害。
生理性心率偏低常见于早产儿或睡眠状态，通常无须特殊治疗，通过保暖、调整喂养方式后1-3天可自行恢复。若因缺氧缺血性脑病引起，需立即给予氧疗并使用盐酸多巴胺注射液改善循环，同时配合亚低温治疗保护脑功能，多数患儿2-4周心率逐渐稳定。先天性完全性房室传导阻滞导致的心率低需安装临时起搏器，术后配合地高辛口服溶液维持心功能，部分患儿可脱离起搏器依赖。
严重心肌炎或复杂先天性心脏病引发的心率低预后较差，即使使用甲泼尼龙琥珀酸钠注射液控制炎症或实施心脏矫治手术，仍可能遗留慢性心律失常。遗传代谢性疾病如长QT综合征需长期服用普萘洛尔口服溶液，但存在猝死风险。
家长发现新生儿心率低于100次/分钟时应立即就医，避免包裹过厚影响呼吸监测，喂养时保持45度体位防止呛奶，定期随访心电图。恢复期可进行抚触刺激促进迷走神经发育，但禁止擅自使用心脏兴奋类药物。若居家使用便携式血氧仪发现心率持续低于80次/分钟或伴随皮肤青紫，须急诊处理。