根管治疗过程中可能出现轻微疼痛，但多数情况下疼痛可控。治疗前会使用局部麻醉药物减轻不适，术后可能出现短暂胀痛，通常1-3天可缓解。
根管治疗是通过清除感染牙髓、消毒根管并填充材料来保存患牙的方法。治疗前医生会注射利多卡因等局部麻醉剂，操作时仅有器械触碰感。少数对麻醉不敏感者可能在清理根管时感到短暂酸胀，但疼痛程度远低于牙髓炎发作时的自发痛。术后因器械刺激或填充材料压迫，患牙可能出现咬合不适，这种胀痛感会随炎症消退逐渐减轻。若出现持续剧烈疼痛或肿胀，可能与残留感染或超充有关，需及时复诊处理。
极少数复杂病例如根尖囊肿、钙化根管等，治疗时间延长可能导致术后反应加重。糖尿病患者或免疫力低下者愈合较慢，疼痛持续时间可能延长至5-7天。对于极度恐惧疼痛的患者，可采用笑气镇静或全麻下治疗。
根管治疗后应避免用患牙咀嚼硬物2-3天，遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊等止痛药。保持口腔清洁可使用氯己定含漱液漱口，术后24小时内避免刷牙刺激创面。定期复查拍摄X线片确认愈合情况，若发现充填物脱落或牙龈脓包需立即就医。日常建议使用含氟牙膏配合牙线清洁，每年进行口腔检查预防新发龋齿。