婴儿腹泻期间通常不建议接种疫苗。腹泻可能影响疫苗效果或加重接种后不良反应，建议等症状缓解后再补种。
婴儿腹泻期间免疫系统处于应对病原体的活跃状态，此时接种疫苗可能干扰机体对疫苗抗原的正常免疫应答，降低抗体生成效率。部分减毒活疫苗如口服脊髓灰质炎疫苗、轮状病毒疫苗等，在肠道炎症环境下可能被过早清除，导致免疫失败。腹泻常伴随发热或脱水，可能掩盖疫苗接种后的典型反应，增加鉴别不良反应的难度。
但若腹泻由非感染性因素引起，如乳糖不耐受或饮食调整，且无发热、呕吐等全身症状时，经医生评估后可考虑接种灭活疫苗。对于传染病流行区或暴露高风险婴儿，专业机构可能建议权衡利弊后接种部分核心疫苗。
家长应记录婴儿腹泻的频次、性状及伴随症状，避免高糖或高纤维食物加重肠道负担。补液盐溶液需按需补充，维持水电解质平衡。疫苗接种前需向医生详细说明近期健康状况，接种后48小时内密切观察体温、精神状态及排便情况。延迟接种的疫苗应按免疫规划及时补种，确保获得完整保护。